常见问题解答
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Q:
雷霆系列限制性内切酶的稳定性如何?运输过程中冻融会对酶的活力产生影响吗?
A:运输过程中以干冰保持低温运输,酶有结冰的可能,但是这对于雷霆系列的限制性内切酶的质量没有影响,我们对所有的酶都进行了至少三次的冻融实验,检测结果表示,酶的活性仍旧是100%。您收到的酶可能是冰袋运输的,请不要担心,这仅仅是由当地的经销商运到您的实验室过程中采取的运输方案,我们经过严格的检测,暴露在4℃下经过24~48 h后仍然不受影响。
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Q:
除了高温还有什么方法能够让雷霆系列限制性内切酶失活?(也不想用苯酚或氯仿)
A:可以使用EDTA终止反应,或者以SDS等蛋白质变性剂使得酶变性。如果酶切产物还要用于下游实验那么可以用胶回收试剂盒进行DNA清洁,回收后酶切反应就被终止了。
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Q:
酶切反应完成后跑凝胶电泳,结果条带与预期不符,可能原因有哪些?
A:可能原因有如下几个:
• 限制性内切酶表现出星活性:确保酶切反应是严格按照说明书推荐的步骤进行的。如果是由星活性引起的那么有以下几个解决方法:①减少反应时间;②增加反应体系的体积;③减少反应中酶的含量。
• 酶切不完全(一个或多个酶切位点有部分DNA底物未被切开),可以尝试加多酶量或者延长反应时间。如果上面的尝试不能很好地解决问题,请从DNA底物上寻找解决方案,DNA底物中是否含有酶切反应抑制剂,将DNA纯化后再进行反应;DNA是否被甲基化,胞内的甲基化系统能够使DNA的特定碱基发生甲基化,而这些甲基化的碱基对于酶切反应有着不同程度的抑制。
• 被未知限制性内切酶污染:未知的限制性内切酶可能通过不当的操作、不纯净的DNA底物、不洁净的管子等途径掺入酶切反应中。
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Q:
有哪些关键因素会导致星活性?
A:长时间孵育、过量的酶、高甘油含量(通常高于5%)、较小的反应体系等因素都会导致星活性的产生。
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Q:
未经纯化的PCR产物直接酶切要怎样设定体系?
A:反应体系推荐由这些内容组成:10 μl PCR产物、2 μl 10×CutOneTM Buffer、1~2 μl相应的限制性内切酶、ddH2O补齐到30 μl。酶的用量根据PCR产物的浓度而定,只加入2 μl反应缓冲液的原因是PCR反应中存在对应的盐离子和金属离子,适当减少反应缓冲液的用量以保证最终反应体系中的环境适宜限制性内切酶发挥功能。
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Q:
雷霆系列限制性内切酶的活力定义是怎样的?
A:雷霆系列限制性内切酶1 U的定义是正好在15 min于20 μl的反应总体系中将1 μg的 DNA底物在1×反应缓冲液的环境中完全消化所需求的酶量。
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Q:
雷霆系列限制性内切酶的活力单位与Thermo Fisher的活力单位或者 NEB的活力单位应该如何换算?
A:由于反应时间,反应体系不同,活力单位无法直接换算。雷霆系列限制性内切酶活力单位是依据反应进行定义的,正好在15 min于20 μl的反应总体系中将1 μg的 DNA底物在1×反应缓冲液的环境中完全消化所需求的酶量为1 U,也就是说反应中加入与DNA底物成比例的酶量即可完成反应。