愚公生物VHH无细胞试剂盒,让AI设计更快落地
AI已经给出了下一批候选,实验还在等待上一批验证结束。
对正在推进AI4S(AI for Science)和AIDD(AI for Drug Discovery)的团队来说,这样的落差并不陌生。
候选可以不断生成,时间却不会凭空增加。
当然,继续使用原有流程有充分理由:方法成熟,人员熟练,单次实验的直接成本也不高。多年建立的操作习惯、设备配置和质量控制,让团队没有理由仅仅因为“快”这个字就切换路线。
真正值得重新算一笔账的,是候选数量上来之后:
如果为了提速,还要额外定制一套昂贵的新系统,新方案的吸引力就会大打折扣。
无细胞蛋白合成提供了另一个切入点:将高通量并行快速表达与功能验证衔接起来,更容易接入通用自动化设备。
研究者可以在更短的时间内完成一批候选的验证,让湿实验反馈跟上AI设计的节奏。
01 提速,可以从实验室已有的设备开始
无细胞蛋白合成(CFPS)把蛋白合成放到体外进行。将基因模板加入反应体系后,即可在2-16小时内实现蛋白表达,省去细胞转化/转染与培养环节。随之配套的还有自动化实施方式,分液、加样、混匀、孵育、稀释,这些操作本就是通用移液工作站和微孔板设备擅长的任务。需要纯化时,磁珠流程也便于对接通用设备。

愚公生物以自主开发的无细胞蛋白合成试剂盒为核心,将并行表达、粗样品亲和力验证和磁珠纯化衔接起来,帮助研发团队把这条路径落到具体项目中。
对于已有相关设备的实验室,这意味着可以优先复用现有平台,逐步搭建并行表达和样品处理流程,无需把“从零定制一条专用自动化产线”作为启动前提。团队可以保留成熟的细胞表达工艺用于后续制备,把候选数量多、迫切需要快速反馈的早期验证交给无细胞体系。先从一个候选批次开始,让实验结果决定下一步投入。
02 让有潜力的候选尽早进入下一轮 也让有限的实验资源更早找到方向
愚公生物已针对纳米抗体(VHH)开发了标准化无细胞表达试剂盒和解决方案,大幅提升纳米抗体设计验证的效率。

无细胞体系可以在自动化设备上,快速平行表达数十到数百个样品。通过无细胞合成的VHH产物,可以省去纯化步骤,按照检测方案简单稀释后,直接使用 SPR 或 BLI 平台记录结合和解离过程。让有潜力的候选尽早进入下一轮。
从方案到曲线:VHH互作结果展示
愚公生物与极瞳生命合作,使用愚公 Cell-Free Protein Synthesis Kit For VHH和极瞳 S-Class SPR 平台,选择已公开报道的靶向 GFP 和 SARS-CoV-2 RBD 的多个VHH抗体,使用 Twin-Strep 标签和 VHH-Fc 融合两类构建策略,为无细胞表达VHH快速进行亲和力评价提供了实例。
在上述联合验证中,愚公生物无细胞试剂盒仅需 8 h 即可完成VHH并行表达,而极瞳S-Class平台可在 24小时内完成所有样品的亲和力表征。
结果表明,无论是未纯化的无细胞反应产物(粗样),还是磁珠纯化产物,均能获得接近文献报告的数值。也体现了国产试剂和分析平台的优异性能和稳健表现。


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不同VHH的亲和力曲线
对VHH候选初筛而言,采用无细胞技术,可以将从基因合成到获得亲和力数据的时间缩短到1周以内。数十到数百个样品的并行表达,再衔接批量亲和力验证,有助于在一轮实验中评价更多候选,减少候选分批排队带来的反馈延迟。研究人员可以更早确定优先级,将后续纯化和精细表征资源集中到有潜力的分子上,并为下一轮设计提供反馈,大幅提高AI4S或AIDD的开发效率。
03 优选之后,三种磁珠纯化路径承接后续研究
完成初筛后,值得继续开发的VHH通常需要获得纯化样品,用于亲和力复测、稳定性研究或细胞功能评价。
愚公生物已验证了3种对于无细胞表达VHH的磁珠快速纯化路径。SDS-PAGE结果显示,三种路径均可富集目标蛋白,可按构建形式选择。对于大多数VHH而言,愚公无细胞表达试剂盒的表达效率能达到 0.3 mg/mL 以上,是国外同类产品的4-5倍。




由此,研究人员可以按项目需要安排两条实验路径:候选较多时,先开展粗样品亲和力初筛;需要精细表征时,再通过磁珠纯化获得样品并继续评价。
04 把下一批VHH设计,交给更紧凑的验证流程
愚公生物VHH无细胞蛋白合成试剂盒,面向VHH发现与工程优化,配套方案覆盖模板设计、表达条件优化和纯化策略选择。以通用自动化设备组织并行处理,为实验室逐步扩大验证通量提供了实施方向。
推荐给正在开展以下工作的团队:
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AI设计候选验证快速将计算筛选序列批量转化为可检测蛋白,获得下一轮设计所需的实验反馈。
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VHH序列与构建优化比较不同候选、标签和Fc融合形式的表达及结合表现。
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抗体发现服务将基因模板制备、无细胞表达与亲和力检测连接成连续流程。
原有方法积累的经验仍然有价值,实验室已有的设备也可以继续发挥作用。团队可以从最需要提速的一段流程开始:大量并行表达一批候选,用粗样捕获检测尽早获得结合数据,让更多候选在同一轮验证中获得评价,再把优选分子送入后续研究,缩短从设计到决策的等待。
欢迎联系愚公生物,交流您的VHH候选规模、现有设备与检测需求,了解自主VHH无细胞蛋白合成试剂盒及配套方案。
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参考文献
[1] Kirchhofer et al. Nat Struct Mol Biol. (2010) 17:133-138
[2] Güttler et al. EMBO J. (2021) 40: e107985


