常见问题解答
-
Q:
我能对用内切糖苷酶释放的聚糖进行荧光标记吗?
A:可以,因为释放的游离寡糖上的还原端是完整的,这使得碳水化合物可以通过所选荧光基团的还原胺化进行标记。请注意,PNGaseF 是一种酰胺酶:在这种情况下,氨基会附着在聚糖的末端,但在 pH 值< 8.5 时极不稳定。游离寡糖释放后(在 pH 值为 7.5 的典型条件下),氨基立即丢失,留下自由还原端,用于还原胺化。
-
Q:
去垢剂会抑制外切糖苷酶/内切糖苷酶吗?
A:在中等水平(0.5~1.0%离子和非离子去污剂)下,大多数糖苷酶显示出令人满意的活性或不受影响。例外情况是:PNGase F(所有产品)、O-糖苷酶和β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶,它们会被SDS抑制。必须将NP-40添加到反应混合物中,使最终浓度为1%,以抵消去污剂的抑制。
常见的稳定试剂,如 吐温、Triton X-100、NP-40、辛基葡萄糖苷和非去垢剂磺基甜菜碱,以及痕量有机溶剂,可以阻止 PNGase F 对糖基又好又快的释放。 -
Q:
什么是糖苷酶?它的用途有哪些?
A:糖苷酶用于获取与糖蛋白和糖肽相连的糖基的信息。它们有两种类型,内切糖苷酶和外切糖苷酶。内切糖苷酶可以将整个糖基从蛋白质上切下来,而外切糖苷酶则从糖的非还原端去除单糖。还原端是指由内切糖苷酶产生的端。研究人员经常先使用内切糖苷酶,然后使用一种或多种外切糖苷酶,最后通过SDS-PAGE或各种类型的液相色谱分析产物。
-
Q:
酶法去糖基化有哪些优势?
A:糖苷酶可以在温和的条件下去除糖基,保持肽键的完整性。酶也可以在天然条件下用于折叠的蛋白质,尽管由于空间位阻和其他限制,它们的作用效率可能较低。
-
Q:
10× PNGase F Buffer有结晶是正常现象吗?
A:是正常现象,其主要组分是Na3PO4,低温会析出,解冻后恢复室温涡旋会复溶。
